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苹果手机设置两个号码发短信不同步的功能，可以通过以下步骤实现。
1、打开“设置”应用，找到“信息”选项，点击进入。
2、在“信息”界面中，找到“SMS/短信/iMessage信息”选项，点击进入。
3、在此界面，可以看到两个号码的选项，点击需要设置发短信不同步的号码，然后找到“短信”或“iMessage信息”开关，将其关闭即可，这样，使用该号码发送的短信或iMessage信息将不再与另一号码同步。
这只适用于iPhone支持双卡的版本，并且两个号码都需要支持短信功能，关闭某个号码的短信同步功能后，该号码将不会接收到或发送短信，因此需要谨慎操作，确保了解清楚运营商对于使用两个号码的相关规定，以避免产生额外的费用。
仅供参考，如遇到操作问题，建议咨询苹果官方客服或前往苹果专卖店寻求帮助。